进水电导（或TDS）比设计值高出很多，对于NaCl溶液TDS每增加1000ppm，则渗透压增加约11.4psi（0.8bar），相同进水压力下，产水量将减少。
膜元件装入系统前没有确认进水是否达标，导致用含有阳离子、中性、两性表面活性剂，或含有其他与膜不兼容的化学品的进水浸泡冲洗膜元件，致使膜元件用量减少，系统产水量下降。
反渗透纯水设备进水温度比初始设计时低，进水温度每下降3度产水量减少10%。
出现仪器仪表读数误差，压力表流量计使用前没有校正，读数不正确；或是压力表安装位置离压力容器两端较远，其读数含有管路的压力损失，但被作为进水压力则导致进水压力偏低，产水量偏低。
相同进水压力下，由于产水侧设置憋压或者产水管路偏小输送点远、高造成阻力较大，导致净压力减小，产水量减少。
正常情况下，反渗透纯水设备两端压差约3-4bar，管路设计不合理导致压力损失较大或者二段浓水排放阀不关闭，这些都将导致净压力减少，从而导致产水量减少。
